特点不同、生活习惯不同。
1、特点不同。蟹虎鱼，属鲈形目鰕鯱鱼亚目沙塘鳢科沙塘鳢属的一种鱼类，是一种淡水小型食肉鱼。虾虎鱼，是虾虎鱼科各虾虎鱼种类的统称，每一种都有符合各自特征的名字，如 “侏儒虾虎鱼”、“寻常虾虎鱼”等。
2、生活习惯不同。蟹虎鱼生活于河沟及湖泊近岸多水草、瓦砾、石隙、泥沙的底层。冬季潜伏在水层较深处或石块下越冬，以虾、小鱼为主要食物。虾虎鱼，游泳力不强，活动范围较窄。少数种类有生殖洄游习性，进入河川。虾虎鱼的食性很杂，比它小的鱼、虾、蠕虫及其他鱼类的卵都是虾虎鱼的食物。
